از جمله مهمترین اهداف نشریه پژوهه باستان سنجی عبارتند از :

•     انتشار مقالات علمی –پژوهشی و مقالات علمی مروری ناب مربوط به باستان‌سنجی و ارائه نتایج تحقیقات نظری و عملی پژوهشگران و مراکز علمی  
•     ارتقای سطح دانش و پژوهش درباستان سنجی  کشور
•     ایجاد بستر و زمینه‌ای مناسب برای ارتباط علمی و تبادل افکار میان پژوهشگران، اساتید دانشگاهی و دانشجویان.

مقالات می­ بایست مطابق با زمینه تخصصی نشریه در حوزه باستان‌سنجی بر اساس محورهای ذیل باشند:

• ۱-  تاریخ‌گذاری و تعیین منشاء مواد باستانی
• توسعه و کاربرد روش‌های تاریخ‌گذاری مطلق (رادیوکربن، لومینسانس، پتاسیم-آرگون و ...) و تاریخ گذاری نسبی.
• ردیابی و تعیین منشاء مواد خام (سنگ، سفال، فلز، شیشه و ...) با استفاده از روش‌های زمین‌شیمیایی و ایزوتوپی.
• منشاءیابی و مطالعه شبکه‌های مبادله در گذشته.
• ۲- تحلیل مواد و فناوری‌های ساخت
• شناسایی ترکیب شیمیایی، فازهای کانی‌شناسی و ریزساختار مواد باستانی (سفال، فلز، شیشه، رنگدانه، سنگ و ...).
• مطالعه فناوری‌های تولید، تکنیک‌های ساخت و زنجیره‌های عملیاتی بر اساس آنالیز داده های باستان شناختی.
• بررسی فرآیندهای تخریب و هوازدگی مواد در بافت باستان‌شناختی.
• ۳- زیست‌باستان‌شناسی و بوم‌شناسی گذشته
• تحلیل بقایای جانوری و گیاهی حاصل از کاوشهای باستان شناختی
• مطالعات ایزوتوپی پایدار بر روی بقایای انسانی و جانوری برای بازسازی رژیم غذایی، جابجایی و مهاجرت.
• تحقیقات مرتبط با DNA باستانی و پروتئومیکس.
• تافونومی و فرآیندهای تشکیل محوطه­های باستان شناختی.
• ۴- بازسازی محیط‌های گذشته و تعامل انسان-محیط
• بازسازی دیرین اقلیم و دیرین محیط با استفاده از شواهد زمین‌شناسی، رسوب‌شناسی و زیستی.
• تحلیل خاک‌های باستانی، فرسایش و تحول منظر.
• مطالعه تطبیقی و تکاملی اکوسیستم‌های تحت تأثیر انسان مبتنی بر شواهد آزمایشگاهی زمین‌شناختی، زیستی و ژئوشیمیایی، و مدل‌سازی کمی.
• ۵- حفاظت علمی و مطالعات میراث فرهنگی
• شناسایی عوامل تخریب فیزیکی، شیمیایی و زیستی آثار تاریخی.
• توسعه و ارزیابی روش‌های نوین حفاظت، تثبیت و پایش وضعیت آثار تاریخی.
• کاربرد روش‌های غیرمخرب و کم‌مخرب (NDT/ micro-NDT) در تشخیص و مطالعه آثار تاریخی.
• آنالیز مواد و تکنیک‌های ساخت در نمونه­های هنری و معماری تاریخی.
• ۶-  فناوری‌های دیجیتال و کمی‌سازی در باستان‌شناسی و حفاظت
• سنجش از دور (RS)، سیستم‌های اطلاعات جغرافیایی (GIS) و مدل‌سازی مکانی در باستان‌شناسی.
• تصویربرداری طیفی، فتوگرامتری و مدل‌سازی سه‌بعدی.
• کاربرد هوش مصنوعی، یادگیری ماشین و تحلیل داده‌های بزرگ در پردازش و تفسیر داده‌های باستان‌شناختی.
• شبیه‌سازی و مدل‌سازی فرآیندهای باستان‌شناختی، تخریب و حفاظت.
• توسعه پایگاه‌های داده و سیستم‌های یکپارچه مدیریت داده‌های میراث فرهنگی.